層析實驗常用于分離純化蛋白質、抗體等。層析柱是層析實驗的主體，可根據所要分離的樣品的大小、性質決定層析柱的直徑尺寸和填充物。

　層析柱的尺寸根據被分離物的量來確定，其直徑與高度之比則根據被分離混合物的分離難易而定，一般在1∶8到1∶50之間。柱身細長，分離效果好，但可分離的量小，且分離所需時間長;柱身短粗，分離效果較差，但一次可以分離較多的樣品，且所需時間短。如果待分離物各組分較難分離，宜選用細長的柱子，如果要處理大量的較易分離的或對分離純度要求較低的混合物，則可選用粗而短的柱子。最常使用的層析柱，直徑與長度之比在1∶8到1∶15之間。